台州学院三门研究院是由三门县人民政府和台州学院共同组建的综合性和应用型产学研平台，是台州学院在校外建立的首个服务地方经济发展的产学研机构。
三门研究院的宗旨是根据三门县的经济社会发展需求，依托台州学院的人才和科技优势，以技术创新、产品研发、成果转化、知识产权保护、高新技术企业培育和高端人才引进为首要任务，打造集“项目研究、成果转化、技术服务、人才培养与培训”等功能于一体的专业化科技服务平台，推进台州学院和三门县的校地合作，提升三门县域企业的产品开发与技术创新的能力，成为三门县经济发展强有力的产学研平台和创新服务载体。
三门研究院下设橡胶产业发展研究所、乡村振兴研究所、植物资源与环境研究所和智能制造与先进装备研究所等四个机构，通过“台州天君科技有限公司”(简称：天君科技)运营载体进行公司化运作。
天君科技于2018年12月17日注册成立，注册资金100万元，是由台州学院资产经营有限公司(持股60%)和三门县晏站涂建设有限公司(持股40%)共同持股的国有企业。
目前，校地共建三门研究院已进入第二轮合作期，已建成1个研发中心、3个“玫瑰花原料种植示范基地”、1个“黄精育种育苗基地”、1个“三叶青、赤松茸、黄精林下种植示范基地”和1个“车厘子套种黄精、三叶青立体种植示范基地”，正在积极筹建“亭旁中草药研究加工中心”。
